Zero_Ram
2020-03-01T09:01:35+00:00
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[最新：意学者论文显示#新冠病毒起源时间早于武汉发现首例# | 中国绿发会COVID-19速递]
近日，一组意大利学者撰文，阐述研究显示，#新型冠状病毒# 有可能在2019年10月至11月就已经开始传播。这篇意大利米兰国立大学的论文于2020年2月25日在线发表于《医学病毒学杂志》(Journal of Medical Virology)，题目为《SARS CoV 2有效繁殖数量的早期系统发育评估》(Early phylogenetic estimate of the effective reproduction number of SARS CoV 2)。
图1：《医学病毒学杂志》4月号封面(来源：Wiley Online Library)
以下是绿会国际部同事整理为中文的该论文摘要，(限于水平，可能存在与原文不尽吻合之处)，供读者参考。
[摘要]
为了重建最近在中国武汉爆发的新型冠状病毒的进化动态，全球共享所有流感数据倡议组织于2020年2月4日提供的52个SARS CoV 2基因组被进行了分析。用于估计繁殖数量的两个模型(基于合并的指数增长和出生-死亡天际线法)表明，估计的平均进化率为7.8×10?4个子/位点/年(范围1.1×10?4 15×10?4)和树根的平均tMRCA为73天。估计的R值为2.6 (范围为2.1 5.1)，并且在2019年12月从0.8上升至2.4。该流行病的估计平均倍增时间在3.6天到4.1天之间。这项研究证明了即使在流行病流行的情况下，系统发育学也有助于监测新出现的新感染。
(图2来源：Wiley Online Library)
该论文强调：
·本研究的目的是研究SARS CoV 2的时间起源、病毒进化速率和种群动态。
·所使用的贝叶斯方法指出了2019年10月至11月间该流行病最可能的起源。
·到2019年12月，当平均翻倍时间为4天左右时，预计有效繁殖数从0.8增加到2.4。
·本研究证明了系统发育在监测新发感染中的作用。
同时，围绕该论文得出的结论，绿会还了解到以下信息：
模型结论：新型冠状病毒早在2019年10-11月就已经开始传播。
本研究中获得的SARS-CoV-2系统发育的时间重建与先前的估计相符，表明该流行病起源于2019年10月至2019年11月之间，即描述第一例病例(武汉能查证到的12月1日最早病例)数周之前。这通过合并分析和估计流行病起源的出生死亡方法得到了证实。
(图3来源：Wiley Online Library)
意大利学者认为新型冠状病毒在去年12月中旬就已经在意大利爆发，之前检出的38岁的意大利科多尼奥男子并非该国第一个病患，否则解释不了意大利在短时间内突然检查出来几百例被传染者。
另据报道，去年圣诞节期间意大利皮亚琴察市医院已经住满了40多例异常肺炎患者。
[参考链接：]
《医学病毒学杂志》在线论文原文《SARS CoV 2有效繁殖数量的早期系统发育评估》
[url]//url.not.available/[/url]
《SARS CoV 2有效繁殖数量的早期系统发育评估》PDF版本：
[url]//url.not.available/[/url]
整理/Maggie 审/Emilie 编/Angel
[最新：意学者论文显示#新冠病毒起源时间早于武汉发现首例# | 中国绿发会COVID-19速递]
近日，一组意大利学者撰文，阐述研究显示，#新型冠状病毒# 有可能在2019年10月至11月就已经开始传播。这篇意大利米兰国立大学的论文于2020年2月25日在线发表于《医学病毒学杂志》(Journal of Medical Virology)，题目为《SARS CoV 2有效繁殖数量的早期系统发育评估》(Early phylogenetic estimate of the effective reproduction number of SARS CoV 2)。
图1：《医学病毒学杂志》4月号封面(来源：Wiley Online Library)
以下是绿会国际部同事整理为中文的该论文摘要，(限于水平，可能存在与原文不尽吻合之处)，供读者参考。
[摘要]
为了重建最近在中国武汉爆发的新型冠状病毒的进化动态，全球共享所有流感数据倡议组织于2020年2月4日提供的52个SARS CoV 2基因组被进行了分析。用于估计繁殖数量的两个模型(基于合并的指数增长和出生-死亡天际线法)表明，估计的平均进化率为7.8×10?4个子/位点/年(范围1.1×10?4 15×10?4)和树根的平均tMRCA为73天。估计的R值为2.6 (范围为2.1 5.1)，并且在2019年12月从0.8上升至2.4。该流行病的估计平均倍增时间在3.6天到4.1天之间。这项研究证明了即使在流行病流行的情况下，系统发育学也有助于监测新出现的新感染。
(图2来源：Wiley Online Library)
该论文强调：
·本研究的目的是研究SARS CoV 2的时间起源、病毒进化速率和种群动态。
·所使用的贝叶斯方法指出了2019年10月至11月间该流行病最可能的起源。
·到2019年12月，当平均翻倍时间为4天左右时，预计有效繁殖数从0.8增加到2.4。
·本研究证明了系统发育在监测新发感染中的作用。
同时，围绕该论文得出的结论，绿会还了解到以下信息：
模型结论：新型冠状病毒早在2019年10-11月就已经开始传播。
本研究中获得的SARS-CoV-2系统发育的时间重建与先前的估计相符，表明该流行病起源于2019年10月至2019年11月之间，即描述第一例病例(武汉能查证到的12月1日最早病例)数周之前。这通过合并分析和估计流行病起源的出生死亡方法得到了证实。
(图3来源：Wiley Online Library)
意大利学者认为新型冠状病毒在去年12月中旬就已经在意大利爆发，之前检出的38岁的意大利科多尼奥男子并非该国第一个病患，否则解释不了意大利在短时间内突然检查出来几百例被传染者。
另据报道，去年圣诞节期间意大利皮亚琴察市医院已经住满了40多例异常肺炎患者。
[参考链接：]
《医学病毒学杂志》在线论文原文《SARS CoV 2有效繁殖数量的早期系统发育评估》
[url]//url.not.available/[/url]
《SARS CoV 2有效繁殖数量的早期系统发育评估》PDF版本：
[url]//url.not.available/[/url]
整理/Maggie 审/Emilie 编/Angel