薛勇彪/陈华团队在法国2007至2012年流感季的流感患者样本中发现人工改造的SARS-CoV病毒基因组

在该研究中，科研团队重新分析了取自101例甲型流感病毒感染者咽拭子的宏基因组测序数据。这些数据来自NCBI公共数据库，是由法国巴斯德研究所于2007年至2012年间为了研究甲型流感而收集样本并测序的，跨越了五个连续的流感季节。研究人员从22例样本中鉴定出了SARS-CoV 序列，其中3个序列的读段已覆盖全基因组。SARS-CoV曾在2002-2003年引发严重急性呼吸综合征(SARS/非典)，在2003年之后就基本消失了，但为何在2007年至2012年间的甲流病人体内发现SARS-CoV病毒？为了探究其发生的原因，该研究团队进一步与NCBI核酸数据库中收录的250条SARS-CoV序列进行比较分析。通过比较序列的相似性，突变模式以及采样时间等，发现这3条序列与美国J. Craig Venter研究所提交的人工构建的SARSr-CoV重组株系高度相似(相似度分别是99.99%和99.7%)，并论证表示这3条序列并非从自然产生的SARS-CoV序列独立进化而来。

此外，这些来自几个不同流感季的样本含有不同类型的SARS-CoV株系。对于以上的发现，一种可能的解释是，人工构建的重组SARS-CoV在2007年和2009年左右分别从实验室泄漏，但没有导致广泛的SARS-CoV感染。据报道，法国巴斯德研究所曾于2014年丢失过含有SARS患者样本的小瓶。另一种可能的解释是实验室样本污染。进一步的调查有助于澄清这一发现，但无论是哪种可能性，它都敲响了实验室生物安全的警钟，需要全世界科研工作者重视此类问题，加强实验室生物安全管理和树立生物安全意识。


DOI:10.1016/j.bsheal.2021.11.002