gisaid是被训诫了吗(已被楼下高手辟谣)

什么意思？长求总

传统技能了[s:a2:lucky]

小学文凭，请说直白点[s:a2:不明觉厉]

这么不要脸，只会让事情越来越复杂

如果真的改了，此地无银三百两，不是实锤也是实锤了

我前天看确实是第一张图的样子
不过我也不懂那玩意代表什么意思

病毒基因序列突变图，以解释国内外新冠病毒的基因序列和突变点！

序列信息可以通过对比其它病毒序列反推出突变时间，对病毒溯源有重要意义，比如说推理哪个地区的病毒在遗传学意义上更“古老”

又是这个不懂装懂的博主，上次拿时间图说出现几百个子代，包括什么12代之类的，人家一堆兄弟你说人是12代？
这次这个WA45之所以之前那么多突变是因为在前端非编码区一小个片段有连续16个突变，可以看作是测序误差造成的问题，人家重新修正以后就好了。类似的还有现在法国的那一例，是在后端非编码区有连续12个突变也是类似的问题，不过法国人没有重新提交数据罢了。

d开头那个是突变的意思，一开始突变是26，后面改成了10，数字越小意味着离初始毒株越近，变异时间理论上应该比较短，如果是26的话变异代数多，理论存在时间要长些

[quote][pid=406607754,20910910,1]Reply[/pid] Post by [uid=38753905]爱不暖的冬[/uid] (2020-03-21 02:34):

小学文凭，请说直白点[s:a2:不明觉厉][/quote]就是3.19这个网站上传了目前新冠的突变分析情况，发现美国的病毒变异的更多
3.20有人发现这个网站数据改了，美国很多变异的亚型没了

简单来说，故意调错病毒序列，让美国本土的原有病毒变成中国变异而来的 大概是这个意思吧？

[img]https://img.nga.178.com/attachments/mon_202003/21/-7Q5-hsggZ17T3cSu0-1po.jpeg[/img]
刚去看了眼没改啊，这微博博主前几天不就被人喷基本事实都描述错了的民科吗

[quote][pid=406608519,20910910,1]Reply[/pid] Post by [uid=12235917]blackab1[/uid] (2020-03-21 02:42):

就是3.19这个网站上传了目前新冠的突变分析情况，发现美国的病毒变异的更多
3.20有人发现这个网站数据改了，美国很多变异的亚型没了[/quote]看了这么多楼先骑个墙[s:a2:不明觉厉]

[quote][pid=406608445,20910910,1]Reply[/pid] Post by [uid=60875694]cyf123[/uid] (2020-03-21 02:41):

又是这个不懂装懂的博主，上次拿时间图说出现几百个子代，包括什么12代之类的，人家一堆兄弟你说人是12代？
这次这个WA45之所以之前那么多突变是因为在前端非编码区一小个片段有连续16个突变，可以看作是测序误差造成的问题，人家重新修正以后就好了。类似的还有现在法国的那一例，是在后端非编码区有连续12个突变也是类似的问题，不过法国人没有重新提交数据罢了。[/quote]我是搞细菌和真菌的，对病毒不怎么了解，不过我想问一下

”在前端非编码区一小个片段有连续16个突变，可以看作是测序误差造成的问题“

他们的测序是怎么设计的啊？不是用shotgun测的整个基因组？病毒的非编码区里哪些片段影响到测序了？

结合gisaid的数据，研究了一下昨天那个微博(图1)，发现了更多的问题。

1、病毒的美国B1分支“进化了十几代/次”？

病毒“进化了十几代”这个本身就是一个非专业性的表述。这是因为：病毒的突变发生在基因组复制期间，如果按照生物学中代的定义，那么复制一轮就算一代。而因为病毒复制迅速，不可能这几个月来就只复制了十几代。

而如果说是发生的位点突变的数量？那么采用突变位点数/时序图(图2)就能很清楚的看出，截止到3月份，病毒的美国B1分支最多产生了10个点突变，大约1个月出现5个点突变，这个和我国乃至世界范围内的新冠病毒变异位点产生速率相当(欧洲的还稍微更快一些)。

因此，“进化了十几代”本身就是一个有问题的表述，更准确的表述是产生了很多不同的型(即不同的突变位点组合形式)。从图3中可以明显看出，病毒的美国B1分支在2月初出现了一次快速扩张，这意味着发生了病毒的一次快速的人群扩散过程。这在以突变为横轴的图4种也能明显看到。

2、病毒的武汉B1分支没有变化？

事实上，进入gisaid页面([url]//url.not.available/[/url] )选取B分支后可以看到，整个B分支中主要是2月中下旬从湖北省外提交的病毒序列，湖北境内仅有武汉和天门两例序列；如果精确到B1分支，没有一个湖北省内序列！那么显然，压根没有序列提交到数据库里，自然无法得知武汉的病毒的分型情况——这是无米之炊啊。

事实上，在整个gisaid来自中国的125条序列中，来自武汉的序列并不多，且主要集中在2月前，2月提交的序列绝大多数为外省(主要是广东省)。因此gisaid的图无法展示武汉和湖北境内病毒的变化情况。

3、多样性和传染规模有关，而无法反映存在时长，这个我昨天已经讲述过了([url]//url.not.available/[/url] )，不赘述。

综上，病毒的突变速率正常，国内和国外没有显著差异；无法表明病毒的美国B分支存在时间更久(有人跟我讨论定根的问题，如果在给定分析B分支的情况下，那么B分支的根节点就是根的所在，这和全局讨论不同)。因此图1中po主的两个猜测均无法从gisaid的数据获得，系对数据的误读。

而从gisaid的数据中可以看出：1美国在1月底~2月初经历了至少一次病毒的快速大规模扩散，提示此时美国防控措施几乎为没有，毫不负责。2武汉/湖北作为我国疫情最严重的地区，病毒基因组数据反而不如广东提交的多，这不利于病毒传播研究和溯源研究。

#微博辟谣# #科普大作战# #新型冠状病毒#

[quote][pid=406608692,20910910,1]Reply[/pid] Post by [uid=41154075]勤奋好学陈清泉[/uid] (2020-03-21 02:44):

[img]https://img.nga.178.com/attachments/mon_202003/21/-7Q5-hsggZ17T3cSu0-1po.jpeg[/img]
刚去看了眼没改啊，这微博博主前几天不就被人喷基本事实都描述错了的民科吗[/quote]哈，我前两天喷过他，这个惯谣分子不懂装懂，确实受不了。

带带家族…
起码搞个病毒学博士身份的来啊

这种时候最讨厌这种不懂装懂博眼球的人了。可惜大部分人都看不懂这份表，自然只会听信这种没水准的微博主的‘解读’。传递错误资讯难道不算造谣嘛？