问一下硬件区有没有用schrodinger软件做计算的大佬

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🛌Groovydiscodude🛌

2021-03-22T06:14:27+00:00

如题, 最近被老板安排了跑一个项目的分子结构筛选,但是手头的笔记本跑起来太慢了,跑sp精度结果偏差太大,跑xp然后还有基团限定 一组结构要跑好几个小时。
想问一下有用这个软件的大佬,这个软件主要靠cpu还是gpu啊,然后多核性能还是单核。 现在暂时只能先用家里打游戏的电脑跑了,但是也慢。 要是主要靠cpu,都打算换个5900或者5950x了。 要是靠gpu就换不起了
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Aemiliana

[quote][tid=26116847]Topic[/tid] Post by [uid=20505176]低调的板凳[/uid] (2021-03-30 14:20):

如题, 最近被老板安排了跑一个项目的分子结构筛选,但是手头的笔记本跑起来太慢了,跑sp精度结果偏差太大,跑xp然后还有基团限定 一组结构要跑好几个小时。
想问一下有用这个软件的大佬,这个软件主要靠cpu还是gpu啊,然后多核性能还是单核。 现在暂时只能先用家里打游戏的电脑跑了,但是也慢。 要是主要靠cpu,都打算换个5900或者5950x了。 要是靠gpu就换不起了[/quote]这种科学仿真软件慎买AMD,除非你已经确定别人跑起来没有效率问题,保险一点可以买1500的华擎X299+ 大船7940X或者7960X,就是功耗大点
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imanoob

同楼上观点,我们组里面用VASP,新买的机器也都是优先英特尔,就是因为不确定AMD跑不跑的起来。科学计算这方面有时候AMD有莫名其妙的bug
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QC_Xeno

去小木虫问可能更方便一点,这种东西最好不要自己配置,能和老板商量一下还是找经销商买成品,这样有技术支援会好很多,不然以后很多时间会浪费在调试上

哪怕再退一步租个超算几个节点也行,我们学校不少人用超算跑VASP的
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TiredGoblin [4BC Finished]

[quote][tid=26116847]Topic[/tid] Post by [uid=20505176]低调的板凳[/uid] (2021-03-30 14:20):

如题, 最近被老板安排了跑一个项目的分子结构筛选,但是手头的笔记本跑起来太慢了,跑sp精度结果偏差太大,跑xp然后还有基团限定 一组结构要跑好几个小时。
想问一下有用这个软件的大佬,这个软件主要靠cpu还是gpu啊,然后多核性能还是单核。 现在暂时只能先用家里打游戏的电脑跑了,但是也慢。 要是主要靠cpu,都打算换个5900或者5950x了。 要是靠gpu就换不起了[/quote]薛定谔吃cuda的,amd 5950这些pcie总线太少发挥不了md计算和分子建模方面多卡并行的优势,最好是志强或者枭龙这种,现在rtx5000双卡就可以跑得不错了,a6000也行但是30系专业卡在这类软件上比不了20系稳定。

以上是我问我研究假药方面的同事说的 [s:a2:lucky]