系统盘走pch会有很大影响吗

买了台y9kk，加了块980pro，上机才发现第二个m2是pcie3.0的。请问如果把系统盘9a1换到第二个m2口会不会对系统有什么影响，比如说对uefi的兼容性之类的。

980pro是2t的，跑在3.0感觉亏了一个亿，求泥潭大佬给些建议。